Экспозиция музея построена по хронологическому принципу и раскрывает историю формирования и развития пограничной охраны на территории Украины со времен Киевской Руси до наших дней. Экспозиция музея расположена в залах общей площадью 340 кв. м. и насчитывает 1274 экспоната. Среди представленных в музее персоналий 15 Героев Советского Союза, 1 кавалер ордена Славы, 16 пограничников, чьими именами названы заставы, корабли, 4 участника боев на острове Даманский, 12 воинов-интернационалистов, 6 представителей пограничных династий. Работают постоянные выставки огнестрельного, газового и холодного оружия, демонстрируются образцы фальшивых документов, контрабанды, изъятые у нарушителей границы.