Экспозиция музея построена на соединении двух миров в пространстве одной квартиры: мира реального, биографического, связанного с семьей Булгаковых и мира вымышленного, литературного, связанного с романом Булгакова «Белая гвардия». Автор научно-художественной концепции К.Питоева, художник – лауреат государственной премии Украины им. Т.Шевченко А.Крыжопольский. Совместное бытование реального предмета и художественного вымысла, построенное на использовании мемориальных булгаковских вещей и их литературных знаков, позволило найти новые формы музейного повествования, обращенного к жизненному и художественному опыту посетителя, его ассоциативному мышлению. Свою задачу музей видит более широко, чем рассказ о жизни и творчестве Булгакова, который в Киеве писателем еще не был. Экспозиция знакомит со средой, воспитавшей будущего писателя. А потому в ней широко представлены темы: жизнь Киева конца XIX – начала ХХ вв., образование и воспитание, медицина, религиозная и театральная жизнь города.