События разворачиваются в Техасе, в небольшом городке Мирадеро. 12-летняя девочка Лаки переехала сюда недавно. Она выросла без мамы, хотя очень хорошо ее помнит. Помнят женщину и жители города. Прежде всего, благодаря тому, как искусно она ездила верхом. Девочка случайно встречает строптивого и быстрого мустанга. Лаки называет его Спирит. Она – единственная, кому удается найти общий язык с свободолюбивым животным. Девочка найдет себе подруг, таких же искусных всадниц, как и она сама.
Полнометражный анимационный фильм «Спирит Непокорный» является продолжением франшизы, которая началась с выхода в 2002 году мультфильма «Спирит: Душа прерий». Тогда он был номинирован на получение премии «Оскар» за лучший анимационный фильм. Студия Dream Works Animation, которой принадлежит проект, продолжила рассказывать историю в виде мультсериала. Суммарно получилось 78 серий. Новый мультфильм представляет собой переосмысление сюжета мультсериала.